Glównym zadaniem kwarantanny jest bezpieczne przechowywanie zainfekowanych plików. Pliki nalezy poddawac kwarantannie w przypadku, gdy nie mozna ich wyleczyc, gdy ich usuniecie nie jest bezpieczne lub zalecane oraz w przypadku gdy nie powinny one byc wykrywane przez ochrone antywirusowa.
Uzytkownik moze poddawac kwarantannie dowolne pliki. Takie dzialanie jest zalecane, jesli plik zachowuje sie w podejrzany sposób, ale nie jest wykrywany przez skaner antywirusowy. Pliki poddane kwarantannie mozna przesylac do analizy w laboratorium firmy ESET.

Pliki przechowywane w folderze kwarantanny moga byc wyswietlane w tabeli zawierajacej date i godzine przeniesienia do kwarantanny, sciezke do pierwotnej lokalizacji zainfekowanego pliku, rozmiar pliku w bajtach, powód (dodane przez uzytkownika…) oraz liczbe zagrozen (na przyklad jesli plik jest archiwum zawierajacym wiele zagrozen).