Skanowanie niestandardowe stanowi optymalne rozwiazanie, jesli uzytkownik chce sam okreslic parametry skanowania, takie jak skanowane obiekty i metody skanowania. Zaleta skanowania niestandardowego jest mozliwosc szczególowej konfiguracji parametrów. Konfiguracje mozna zapisywac w postaci tzw. profili skanowania. Profile te sa szczególnie przydatne, jesli skanowanie jest wykonywane wielokrotnie z zastosowaniem tych samych parametrów zdefiniowanych przez uzytkownika.

Aby wybrac obiekty skanowania, nalezy uzyc menu rozwijanego umozliwiajacego szybki wybór obiektów lub wybrac je w strukturze drzewa zawierajacej wszystkie urzadzenia dostepne w komputerze. Ponadto po kliknieciu kolejno opcji Ustawienia > Leczenie mozna wybrac jeden z trzech dostepnych poziomów leczenia. Jesli uzytkownik chce tylko przeskanowac system bez wykonywania dodatkowych dzialan, nalezy zaznaczyc opcje Skanuj bez leczenia.

Skanowanie komputera w trybie skanowania niestandardowego jest przeznaczone dla zaawansowanych uzytkowników, którzy maja juz doswiadczenie w poslugiwaniu sie programami antywirusowymi.